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Journal Article 2017-01

VirusDetect: an automated pipeline for efficient virus discovery using deep sequencing of small RNAs.

Autor: Yi Zheng Shan Gao Padmanabhan, C. Li, R. Galvez, M. Gutiérrez, D. Fuentes, S. Kai-Shu Ling Kreuze, J.F. Zhangjun Fei

Accurate detection of viruses in plants and animals is critical for agriculture production and human health. Deep sequencing and assembly of virus-derived small interfering RNAs has proven to be a highly efficient approach for virus discovery. Here we present VirusDetect, a bioinformatics pipelin...

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/80028

Investigación en Agricultura

VIRUS INDEXING

RNA

RNA SEQUENCE

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Yi Zheng , Shan Gao , Padmanabhan, C. , Li, R. , Galvez, M. , Gutiérrez, D. , Fuentes, S. , Kai-Shu Ling , Kreuze, J.F. , Zhangjun Fei , [VirusDetect: an automated pipeline for efficient virus discovery using deep sequencing of small RNAs.] , VirusDetect: an automated pipeline for efficient virus discovery using deep sequencing of small RNAs.

Conference Paper 2013

Caracterizacion molecular de aislamientos de sweepovirus que infectan Ipomoea batatas (L.) Lam. y estudio de sinergismo con el sweet potato chlorotic stunt virus (SPCSV).

Autor: Galvez, M. Cuéllar, Wilmer J. Fuentes, S. Kreuze, J.F.

Los sweepovirus forman un grupo dentro del genero Begomovirus que se caracterizan por infectar solo a camote, los cuales comunmente causan infeccion asintomatica, pasando inadvertidos, por lo que su prevalencia y distribucion es desconocida en algunas regiones del mundo. Las infecciones multiples...

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/57043

Investigación en Agricultura

SWEET POTATOES

PLANT VIRUSES

GENOMES

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Galvez, M. , Cuéllar, Wilmer J. , Fuentes, S. , Kreuze, J.F. , [Caracterizacion molecular de aislamientos de sweepovirus que infectan Ipomoea batatas (L.) Lam. y estudio de sinergismo con el sweet potato chlorotic stunt virus (SPCSV).] , Caracterizacion molecular de aislamientos de sweepovirus que infectan Ipomoea batatas (L.) Lam. y estudio de sinergismo con el sweet potato chlorotic stunt virus (SPCSV).

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