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Journal Article 2013

The complete nucleotide sequence of sweet potato C6 virus : a carlavirus lacking a cysteine-rich protein

Autor: Souza, J. de Fuentes, S. Savenkov, E.I. Cuéllar, Wilmer J. Kreuze, J.F.

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/51441

Investigación en Agricultura

SWEET POTATOES

VIRUSES

NUCLEOTIDE SEQUENCE

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Souza, J. de , Fuentes, S. , Savenkov, E.I. , Cuéllar, Wilmer J. , Kreuze, J.F. , [The complete nucleotide sequence of sweet potato C6 virus : a carlavirus lacking a cysteine-rich protein] , The complete nucleotide sequence of sweet potato C6 virus : a carlavirus lacking a cysteine-rich protein

Journal Article 2017-06

Using small RNA-seq data to detect siRNA duplexes induced by plant viruses.

Autor: Niu, X. Sun, Y. Chen, Z. Li, R. Padmanabhan, C. Ruan, J. Kreuze, J.F. Ling, K.S. Fei, Z.J. Gao, S.

Small interfering RNA (siRNA) duplexes are short (usually 21 to 24 bp) double-stranded RNAs (dsRNAs) with several overhanging nucleotides at both 5'- and 3'-ends. It has been found that siRNA duplexes bind the RNA-induced silencing complex (RISC) and cleave the sense strands with endonucleases. I...

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/82687

Investigación en Agricultura

RNA

VIROLOGY

PLANT VIRUSES

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Niu, X. , Sun, Y. , Chen, Z. , Li, R. , Padmanabhan, C. , Ruan, J. , Kreuze, J.F. , Ling, K.S. , Fei, Z.J. , Gao, S. , [Using small RNA-seq data to detect siRNA duplexes induced by plant viruses.] , Using small RNA-seq data to detect siRNA duplexes induced by plant viruses.

Journal Article 2014

The complete genome sequences of two isolates of potato black ringspot virus and their relationship to other isolates and nepoviruses.

Autor: Souza Richards, R. Adams, I.P. Kreuze, J.F. Souza, J. de Cuéllar, Wilmer J. Dullemans, A.M. Vlugt, René A.A. van de Glover, R. Hany, U. Dickinson, M. Boonham, N.

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/64892

Investigación en Agricultura

POTATOES

GENOMES

NUCLEOTIDE SEQUENCE

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Souza Richards, R. , Adams, I.P. , Kreuze, J.F. , Souza, J. de , Cuéllar, Wilmer J. , Dullemans, A.M. , Vlugt, René A.A. van de , Glover, R. , Hany, U. , Dickinson, M. , Boonham, N. , [The complete genome sequences of two isolates of potato black ringspot virus and their relationship to other isolates and nepoviruses.] , The complete genome sequences of two isolates of potato black ringspot virus and their relationship to other isolates and nepoviruses.

Conference Paper 2013

Analisis de la diversidad genetica de aislamientos de PVY infectando Solanum spp en los Andes mediante secuenciamiento de siRNA: Deteccion y caracterizacion de un nuevo linaje recombinante de PVY.

Autor: Flores, B. Silvestre, R. Muller, G. Villamil, A. Guzmán, M. Flores, M. Kreuze, J.F.

El virus Y de la papa (PVY), virus representativo del genero Potyvirus, es uno de los virus de mayor incidencia en los cultivos de Solanaceas, tales como la papa, tabaco y pimiento. PVY existe como un complejo de variantes (strains) que son distinguidos principalmente por los sintomas desarrollad...

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/57042

Investigación en Agricultura

POTATOES

POTATO Y POTYVIRUS

PLANT VIRUSES

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Flores, B. , Silvestre, R. , Muller, G. , Villamil, A. , Guzmán, M. , Flores, M. , Kreuze, J.F. , [Analisis de la diversidad genetica de aislamientos de PVY infectando Solanum spp en los Andes mediante secuenciamiento de siRNA: Deteccion y caracterizacion de un nuevo linaje recombinante de PVY.] , Analisis de la diversidad genetica de aislamientos de PVY infectando Solanum spp en los Andes mediante secuenciamiento de siRNA: Deteccion y caracterizacion de un nuevo linaje recombinante de PVY.

Conference Paper 2013

Secuencia genomica completa de un aislado peruano de Andean potato mottle virus (APMoV, genero Comovirus) utilizando secuenciamiento de siguiente generacion.

Autor: Souza, J. de Muller, G. Cuéllar, Wilmer J. Kreuze, J.F.

Andean potato mottle virus (APMoV, genero Comovirus) es un patogeno importante de varias plantas Solanaceas, que incluyen papa, tomate y tabaco, pero hasta la fecha solo esta disponible datos de secuencias parciales. En este estudio, se determino el genoma completo de APMoV utilizando secuenciami...

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/57041

Investigación en Agricultura

POTATOES

NUCLEOTIDE SEQUENCE

PLANT VIRUSES

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Journal Article 2015

Deep sequencing of virus derived small interfering RNAs and RNA from viral particles shows highly similar mutational landscape of a plant virus population.

Autor: Kutnjak, D. Rupar, M. Gutiérrez Aguirre, I. Curk, T. Kreuze, J.F. Ravnikar, M.

Enlace original: https://cgspace.cgiar.org/handle/10568/65099

Investigación en Agricultura

POTATOES

RNA

NUCLEOTIDE SEQUENCE

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Kutnjak, D. , Rupar, M. , Gutiérrez Aguirre, I. , Curk, T. , Kreuze, J.F. , Ravnikar, M. , [Deep sequencing of virus derived small interfering RNAs and RNA from viral particles shows highly similar mutational landscape of a plant virus population.] , Deep sequencing of virus derived small interfering RNAs and RNA from viral particles shows highly similar mutational landscape of a plant virus population.

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Analisis de la diversidad genetica de aislamientos de PVY infectando Solanum spp en los Andes mediante secuenciamiento de siRNA: Deteccion y caracterizacion de un nuevo linaje recombinante de PVY.

Secuencia genomica completa de un aislado peruano de Andean potato mottle virus (APMoV, genero Comovirus) utilizando secuenciamiento de siguiente generacion.

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Analisis de la diversidad genetica de aislamientos de PVY infectando Solanum spp en los Andes mediante secuenciamiento de siRNA: Deteccion y caracterizacion de un nuevo linaje recombinante de PVY.

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Secuencia genomica completa de un aislado peruano de Andean potato mottle virus (APMoV, genero Comovirus) utilizando secuenciamiento de siguiente generacion.

[78045.pdf]

Deep sequencing of virus derived small interfering RNAs and RNA from viral particles shows highly similar mutational landscape of a plant virus population.

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